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外商投资企业股权转让所涉及的税种主要有三种：企业所得税、营业税、印花税。根据《外商投资企业和外国企业所得税法》的规定，外商投资企业的外方投资者应就其股权转让收益缴纳外国企业所得税，其税率为所得收益的 20％。但中国许多存在税收优惠政策的地区，该20％的税率可以减为10％；如果外方投资者所在国家与中国签订有避免双重征税协定，则该20％的税率也可减为10％。如果中方投资者转让其持有的外商投资企业的股权，其所得则应当缴纳中国企业所得税，税率为33％。

从理论上讲，如果外商投资企业的股权是以成本价转让而没有任何收益，该外国股东即不应因该股权转让而缴纳任何外国企业所得税。但在中国税务实践中，只有关联企业的股权重组以成本价转让，才能得到中国税务机关的免税批准。中国法律规定，在以合理经营为目的进行的公司重组中，外国企业将其持有的中国境内企业股权，或者外商投资企业将其持有的中国境内、境外企业的股权转让给与其有直接拥有或者间接拥有或被同一人拥有 100％股权关系的公司，包括转让给具有上述股权关系的境内投资公司的，可按股权成本价转让，由于不产生股权转让收益或损失，不记征其所得税。在其他非关联公司的交易中，如果是以股权成本价转让，税务机关通常会进行审查，以确定该交易的真实性。

营业税，在股权转让场合，主要是在所转让股权为无形资产时才征收，如果投资者以无形资产投资入股，例如商标等无形资产或者以土地使用权入股的，在转让股权时，应交纳转让价格 5％的营业税。如果转让价格明显偏低且无正当理由的，中国税务机关有权核定其转让价格作为营业税的纳税基础。

印花税，主要是针对合同及其他文书征收的税种，税率为万分之五，计税基础为股权转让价格或该股权的实际价值。